电视剧《促醒者》结局了。司徒秀赢要王芷蘅出院，韩西林以删除化瘤丹改良数据来威胁她。王恒之担心韩西林会一时冲动，决定孤注一掷，还特意给谷麦子发了信息。可是他不知道这个“谷麦子”其实已经变成了丁远志。为了抓住王恒之或者说为了确定是不是王恒之，众人布了一个很大的局。
出院后，医院患者的病历发给了韩西林，他们得的都是脑胶质瘤，结合沈先知的信，整件事情的脉络便清楚了。韩西林和丁远志找到司徒秀赢，他们一起为王恒之演了一场戏。郝大卫在王恒之要他拷贝化瘤丹数据时，他就告诉了韩西林，他精湛的演技，骗过了观众，也骗过了王恒之。
王恒之拷贝了实验数据，可当他离开时，他看见了韩西林，而且大门也被韩西林锁了。王恒之故意装糊涂，结果被韩西林无情戳穿，韩西林让他去自首，就像当初的丁学坤一样。
如果王恒之法律上犯了点错误，丁学坤可能还会帮他，可他的道德沦丧，丁学坤看见他只想吐，但最后丁学坤还是找到川田佳子，填了王恒之挪用集资款的窟窿。丁学坤确实有抑郁症，当年他的妻子得了脑胶质瘤，他用了化瘤丹，结果当天就并发症去世，连最后一面都没有见到。他以为王恒之会拿这件事威胁他，最后伤害到韩西林和丁远志。而实际上是王恒之匿名举报他倒卖救心丸药方。借着这个契机，司徒秀赢和韩阔海逼迫丁学坤进行双盲实验，导致丁学坤别无选择。
王恒之兢兢业业三十六年，到最后都没当上主任，他是对不起九院，可九院对得起他吗？其实还是他自己能力不行，难堪大任。司徒秀赢其实也不想从里面走出来的那个人是王恒之。王恒之被抓后，韩西林没敢去看他，只是让丁远志带了一包瓜子。电话里，王恒之说他不怨韩西林。
王芷蘅的脑胶质瘤有缩小的迹象，司徒秀赢打算进行双盲实验，还给了韩西林和丁远志一天的时间来考虑。韩西林知道自己可能要离开九院了，他打算收养王芷蘅，对他进行院外治疗。然而经过王恒之的事后，韩阔海感触颇深，他想当一个父亲，他改变了坚持二十多年的想法，但司徒秀赢肩负着整个九院，九院要创新，要发展。
林雅婕的家属要把她接回家照顾，司徒秀赢去见她，看到神志不清的林雅婕，司徒秀赢似乎也改变了想法。所以当韩西林准备承担责任时，司徒秀赢给他看了化瘤丹上市无限期延后的公告。
其实司徒秀赢的目的就是想和瑞典方合作，化瘤丹不上市难道九院就倒闭了？好在最后中西医结合的项目得到认可，两方顺利达成合作。这可以说是一个圆满的结局了。可惜里面并没有多少感情戏，只有韩西林和丁远志的兄弟情。